MBS (Muhammadiyah Boarding School) Prof Hamka Kota Madiun merupakan sekolah berbasis Islami yang memadukan antara pengetahuan agama dan umum dalam proses pendidikannya dan berada dalam satu tempat MBS Prof Hamka merupakan model pendidikan berbasis pondok (boarding) yang memberikan sentuhan kognitif, afektif, dan psikomotorik secara komprehensif. Adapun program unggulan MBS Prof HAMKA yaitu:
Tahsin
Tahsin Al-Qur’an, Tahsin merupakan ilmu yang mempelajari untuk memperbagus bacaan Al-Qur’an, dengan metode An-nur
Tahfidz
Tahfidz merupakan ilmu untuk menghafal Al-Qur’an. Dengan metode 4T & 1M ( Tahsin, Tasmi’, Tafhim, Tikrar, dan Muroja’ah )
Tafhim
Tafhim Al-Qur’an, Tafhim merupakan ilmu yang untuk memahami Al-Qur’an, memahami lafadz dan maknawi
Tathbiq
Tathbiq Al-Qur’an, Tathbiq merupakan proses pengamalan Al-Qur’an di keseharian santri.
